前往日本的游客一般不需要特別注射任何疫苗
然而，基于安全考慮，任何常規疫苗都應適時補接種。近年來，日本陸續出現德國麻疹、麻疹或甚至登革熱（目前尚未有疫苗）的疫情。
應采取預防措施，盡量避免在雨季和夏季遭蚊蟲叮咬。日本腦炎是可能致命的罕見疾病，可以接種疫苗以做預防。如果您只計劃短期造訪，或只會待在東京、大阪、京都等主要城市，就可能不需要注射日本腦炎疫苗。不過，如有任何疑慮，請在出國前咨詢醫生或專業醫療人士。
應適時補接種常規疫苗
何謂常規疫苗接種？
美國疾病管制與預防中心建議，前往日本的游客都應補接種常規疫苗。這類疫苗包括：
麻疹、腮腺炎、德國麻疹 (MMR) 混合疫苗 白喉、破傷風、非細胞型百日咳混合疫苗 (DTaP) 水痘疫苗 小兒麻痹疫苗
另外，部分旅客也應根據在日本的活動內容，考慮接種疫苗或加強接種。
甲肝疫苗（潛在食物和飲水污染）
乙肝疫苗（如果進行刺青、有新的性伴侶或接受任何醫療）
狂犬病疫苗（如果計劃進入洞穴探險，或在蝙蝠出沒的地區從事戶外探險活動）
日本腦炎（請見以下內容）
采取防蚊措施
何謂日本腦炎？
日本腦炎是由經蚊子傳播的病毒性疾病，常見于日本西部地區，夏初和秋季是疫情的高發期。由于病毒是經由蚊子吸食已感染動物、鳥類和哺乳動物的血液而傳播的一種疾病，因此前往稻田、灌溉系統和類似鄉村地區觀光或工作的人最容易遭受感染。
癥狀包括發燒、嚴重頭痛、腹瀉、嘔吐，大多數患者還會陷入嗜睡狀態，不過并不是每個人都會出現癥狀。在極少數情況下，日本腦炎可能會致死。預防日本腦炎的最好辦法，就是接種疫苗和防止被蚊蟲叮咬。務必在出國前依規劃接種疫苗時間。如需更多信息，請咨詢專業的醫師。
日本過去是否曾爆發疫情？
日本偶爾會爆發傳染病疫情。最近爆發的疫情主要是德國麻疹和麻疹，現已得到控制的登革熱疫情，則可追溯至 2014 年出現在東京代代木公園的病媒蚊。
建議前往日本的游客應采取預防措施，并適時補接種常規疫苗，以免意外傳染這些疾病。計劃前往日本的孕婦如果未曾接種德國麻疹疫苗，出國前，應先咨詢專業醫師。
擁擠的公共交通系統可能成為病毒孳生的溫床
何時是日本的感冒和流感高發季節？
整個冬季（十二月到三月）都是日本流感的高發季節。日本的城市人口極為密集，流感病毒會迅速傳播。2018 年日本出現流感瘟疫，共有超過 280 萬人感染流感。CDC（美國疾病管制與預防中心）建議前往日本的游客應每年注射一年一次的流感疫苗，特別是在冬季前往的游客，以此減輕患病后的癥狀。
何謂諾羅病毒？
諾羅病毒又稱"noro"或"腸胃型感冒"，是另一種冬季常見的傳染病。癥狀包括嘔吐、腹瀉，嚴重時還可能出現脫水。預防諾羅病毒傳播的最好方法就是經常洗手。